MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009440	TTA	2	6	56705	56710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_009440	CCA	2	6	56855	56860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_009440	CGA	2	6	56883	56888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_009440	AT	3	6	56939	56944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_009440	TG	3	6	56950	56955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_009440	ACTT	2	8	56964	56971	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_009440	GTA	2	6	56984	56989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_009440	TA	3	6	56988	56993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_009440	TA	3	6	57007	57012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_009440	AGTT	2	8	57056	57063	25 %	50 %	25 %	0 %	146302845
1011	NC_009440	CAA	2	6	57222	57227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302845
1012	NC_009440	GAG	2	6	57241	57246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
1013	NC_009440	CGA	2	6	57342	57347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1014	NC_009440	AGGAA	2	10	57441	57450	60 %	0 %	40 %	0 %	146302845
1015	NC_009440	GTGG	2	8	57463	57470	0 %	25 %	75 %	0 %	146302845
1016	NC_009440	AG	3	6	57522	57527	50 %	0 %	50 %	0 %	146302845
1017	NC_009440	AGTTC	2	10	57536	57545	20 %	40 %	20 %	20 %	146302845
1018	NC_009440	AG	3	6	57609	57614	50 %	0 %	50 %	0 %	146302845
1019	NC_009440	TCC	2	6	57636	57641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302845
1020	NC_009440	GTC	2	6	57651	57656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1021	NC_009440	GA	3	6	57687	57692	50 %	0 %	50 %	0 %	146302845
1022	NC_009440	GGA	2	6	57699	57704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
1023	NC_009440	A	6	6	57712	57717	100 %	0 %	0 %	0 %	146302845
1024	NC_009440	CTA	2	6	57788	57793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302845
1025	NC_009440	TCT	2	6	57810	57815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302845
1026	NC_009440	CATT	2	8	57842	57849	25 %	50 %	0 %	25 %	146302845
1027	NC_009440	AC	3	6	57944	57949	50 %	0 %	0 %	50 %	146302845
1028	NC_009440	CCA	2	6	57950	57955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302845
1029	NC_009440	TCC	2	6	57970	57975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302845
1030	NC_009440	CAGTC	2	10	58028	58037	20 %	20 %	20 %	40 %	146302845
1031	NC_009440	TCC	2	6	58078	58083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302845
1032	NC_009440	C	6	6	58101	58106	0 %	0 %	0 %	100 %	146302845
1033	NC_009440	GGAGCT	2	12	58112	58123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146302845
1034	NC_009440	ACG	3	9	58124	58132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1035	NC_009440	GGT	2	6	58197	58202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302845
1036	NC_009440	CGT	2	6	58236	58241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1037	NC_009440	CGA	2	6	58242	58247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1038	NC_009440	GTT	2	6	58280	58285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302845
1039	NC_009440	CAG	2	6	58351	58356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1040	NC_009440	CCA	2	6	58403	58408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302845
1041	NC_009440	CGA	2	6	58413	58418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302845
1042	NC_009440	TG	3	6	58435	58440	0 %	50 %	50 %	0 %	146302845
1043	NC_009440	GAG	2	6	58507	58512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
1044	NC_009440	AGG	2	6	58541	58546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302845
1045	NC_009440	AT	3	6	58594	58599	50 %	50 %	0 %	0 %	146302845
1046	NC_009440	TTCT	2	8	58645	58652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_009440	CT	3	6	58722	58727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_009440	G	6	6	58772	58777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_009440	ATTTA	2	10	58907	58916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_009440	CT	3	6	58926	58931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_009440	AAG	2	6	58995	59000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302846
1052	NC_009440	CTT	2	6	59026	59031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302846
1053	NC_009440	GAAG	2	8	59054	59061	50 %	0 %	50 %	0 %	146302846
1054	NC_009440	CTC	2	6	59087	59092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302846
1055	NC_009440	CA	3	6	59110	59115	50 %	0 %	0 %	50 %	146302846
1056	NC_009440	AGG	2	6	59324	59329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302847
1057	NC_009440	TCC	3	9	59347	59355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302847
1058	NC_009440	AGA	2	6	59363	59368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302847
1059	NC_009440	CT	3	6	59385	59390	0 %	50 %	0 %	50 %	146302847
1060	NC_009440	CG	3	6	59412	59417	0 %	0 %	50 %	50 %	146302847
1061	NC_009440	GGA	2	6	59427	59432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302847
1062	NC_009440	AAG	2	6	59452	59457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302847
1063	NC_009440	AGG	2	6	59546	59551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302847
1064	NC_009440	A	6	6	59558	59563	100 %	0 %	0 %	0 %	146302847
1065	NC_009440	TAA	2	6	59573	59578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302847
1066	NC_009440	AAC	2	6	59590	59595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302847
1067	NC_009440	AT	3	6	59621	59626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009440	AG	3	6	59650	59655	50 %	0 %	50 %	0 %	146302848
1069	NC_009440	ACC	2	6	59686	59691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302848
1070	NC_009440	GGAA	2	8	59696	59703	50 %	0 %	50 %	0 %	146302848
1071	NC_009440	AGAGG	2	10	59813	59822	40 %	0 %	60 %	0 %	146302848
1072	NC_009440	ATAG	2	8	59823	59830	50 %	25 %	25 %	0 %	146302848
1073	NC_009440	C	6	6	59841	59846	0 %	0 %	0 %	100 %	146302848
1074	NC_009440	CTT	2	6	59960	59965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302848
1075	NC_009440	GAA	2	6	60026	60031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302848
1076	NC_009440	GGA	2	6	60050	60055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302848
1077	NC_009440	GGA	2	6	60161	60166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302848
1078	NC_009440	GA	3	6	60217	60222	50 %	0 %	50 %	0 %	146302848
1079	NC_009440	AT	3	6	60242	60247	50 %	50 %	0 %	0 %	146302848
1080	NC_009440	ATT	2	6	60279	60284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302849
1081	NC_009440	AAT	2	6	60310	60315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302849
1082	NC_009440	TC	3	6	60382	60387	0 %	50 %	0 %	50 %	146302849
1083	NC_009440	CTTT	2	8	60439	60446	0 %	75 %	0 %	25 %	146302849
1084	NC_009440	T	6	6	60538	60543	0 %	100 %	0 %	0 %	146302849
1085	NC_009440	AGG	2	6	60594	60599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302849
1086	NC_009440	ATT	3	9	60651	60659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302849
1087	NC_009440	AGG	3	9	60743	60751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302849
1088	NC_009440	ATA	2	6	60776	60781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302849
1089	NC_009440	ATGG	2	8	60880	60887	25 %	25 %	50 %	0 %	146302849
1090	NC_009440	GAG	2	6	60931	60936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302850
1091	NC_009440	GGA	2	6	60951	60956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302850
1092	NC_009440	GCAG	2	8	61045	61052	25 %	0 %	50 %	25 %	146302850
1093	NC_009440	GGA	2	6	61224	61229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302850
1094	NC_009440	GGATA	2	10	61241	61250	40 %	20 %	40 %	0 %	146302850
1095	NC_009440	AGGG	2	8	61268	61275	25 %	0 %	75 %	0 %	146302850
1096	NC_009440	GAG	3	9	61351	61359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302850
1097	NC_009440	AAAT	2	8	61391	61398	75 %	25 %	0 %	0 %	146302850
1098	NC_009440	AAAG	2	8	61405	61412	75 %	0 %	25 %	0 %	146302850
1099	NC_009440	TGG	2	6	61467	61472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302850
1100	NC_009440	CAA	2	6	61567	61572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302851
1101	NC_009440	GTA	2	6	61616	61621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302851
1102	NC_009440	GGA	2	6	61636	61641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302851
1103	NC_009440	GAGG	2	8	61798	61805	25 %	0 %	75 %	0 %	146302851
1104	NC_009440	ACG	2	6	61995	62000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302851
1105	NC_009440	ACT	2	6	62053	62058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302851
1106	NC_009440	AATG	2	8	62138	62145	50 %	25 %	25 %	0 %	146302851
1107	NC_009440	TGTT	2	8	62170	62177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_009440	GAA	2	6	62239	62244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302852
1109	NC_009440	AT	3	6	62255	62260	50 %	50 %	0 %	0 %	146302852
1110	NC_009440	CTTTA	2	10	62390	62399	20 %	60 %	0 %	20 %	146302852
1111	NC_009440	GGT	2	6	62509	62514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302852
1112	NC_009440	CTA	2	6	62595	62600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302852
1113	NC_009440	GGA	2	6	62617	62622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302852
1114	NC_009440	AAG	2	6	62630	62635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302852
1115	NC_009440	ATA	2	6	62697	62702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302852
1116	NC_009440	CTC	2	6	62727	62732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302852
1117	NC_009440	TTA	2	6	62778	62783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302852
1118	NC_009440	AGG	2	6	62784	62789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302852
1119	NC_009440	AGT	2	6	62807	62812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302852
1120	NC_009440	GTA	2	6	62955	62960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302853
1121	NC_009440	GAG	2	6	62967	62972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302853
1122	NC_009440	GAAA	2	8	63036	63043	75 %	0 %	25 %	0 %	146302853
1123	NC_009440	T	6	6	63100	63105	0 %	100 %	0 %	0 %	146302853
1124	NC_009440	CAC	2	6	63119	63124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302853
1125	NC_009440	GGGAA	2	10	63223	63232	40 %	0 %	60 %	0 %	146302853
1126	NC_009440	ACCC	2	8	63262	63269	25 %	0 %	0 %	75 %	146302853
1127	NC_009440	GGA	2	6	63285	63290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302853
1128	NC_009440	TGG	2	6	63322	63327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302853
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1130	NC_009440	GGT	2	6	63407	63412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302853
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1262	NC_009440	TGG	2	6	70066	70071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302862
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1497	NC_009440	ATA	2	6	85218	85223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302878
1498	NC_009440	GTA	2	6	85235	85240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302878
1499	NC_009440	GGA	2	6	85246	85251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302878
1500	NC_009440	GTG	2	6	85316	85321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302878

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